Jessica Magno
Cientista de Dados e Bioinformata. Formada pela UFPR, tenho experiência em análise de dados biológicos, modelagem estatística e machine learning aplicado.
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Projetos selecionados em Ciência de Dados e Bioinformática
neuriteScan: Pacote R para análise de imagens de neuritos
Pacote R que tem como entrada imagens de fluorescência de células neuronais e retorna ao usuário a densidade de neuritos contidos na imagem. O desenvolvimento desse pacote fez parte da minha dissertação de mestrado e possui como um dos diferenciais a entrada de dados high throughput possibilitando a otimização da análise. Além disso, o neuriteScan faz integração das linguagens R e Python através do pacote R reticulate, a fim de agregar diferentes ferramentas de processamento de imagem.
Dissertação de mestrado no acervo UFPR
Análise de dados lncRNAs de câncer de mama (TCGA-BRCA)
Análise bioinformática de dados long non-coding RNAs (lncRNAs) de câncer de mama. Fui a responsável pela análise completa dos dados da coorte de câncer de mama (BRCA) provenientes do The Cancer Genome Atlas (TCGA), desde a obtenção dos dados, manipulação e pré-processamento, análise de expressão diferencial e confecção do heatmap (Figura 3 do artigo). Essa publicação foi parte de uma colaboração que fiz durante o doutorado, onde estive em contato direto com pesquisadores, geneticistas e professores. Além de fazer a análise bioinformática completa, contribui para a escrita da seção de metodologia e resultados do artigo, o qual foi publicado em 2023.
Artigo publicado na Cancers (2023)
Página em construção. Em breve, outros projetos serão adicionados.